Laboratorium Pengujian DAGH-IPB dikelola dengan menerapkan sistem manajemen mutu ISO 17025:2017 dan telah mendapatkan akreditasi KAN dengan no. LP – 974 – IDN. Untuk melaksanakan sistim jaminan mutu disamping validasi metode, akreditasi. Laboratorium Pengujian DAGH-IPB juga mengikuti Uji banding dan Uji Profisiensi yang secara berkelanjutan sebagai bentuk jaminan mutu kepada pelanggan terhadap hasil pengujian yang telan dilakukan.